Jan Axmacher hat sich im Rahmen seines Studiums der Geoökologie und seiner anschließenden Promotion an der Universität Bayreuth mit biogeographischen Fragestellungen und dabei insbesondere mit Biodiversitätsmustern unterschiedlicher taxonomischer Gruppen in Abhängigkeit von Umweltveränderungen beschäftigt. Nach seiner Promotion und kurzer Mitwirkung am Bayreuther Institut für Ökosystemforschung (BITÖK) und im deutsch-chinesischen Graduiertenkolleg "Sustainable Resource Use in the North China Plain" lehrt er seit 2005 Landschaftsökologie und Naturschutz am University College London (UCL). Hier leitet er auch den MSc-Studiengang in Conservation, den ältesten britischen Naturschutzstudiengang. Sein Forschungsinteresse gilt weiterhin der Erklärung von Biodiversitätsmustern mit Hilfe abiotischer Umweltfaktoren sowie angewandten Aspekten des Naturschutzes.